San Miguel de Neguera es un despoblado de la provincia española de Segovia, perteneciente al término municipal de Sebúlcor. La aldea se halla actualmente en ruinas.
Por la localidad trascurre el Camino de San Frutos, en su quinta etapa.
En su término se encuentra el Palacio de los González de Sepúlveda declarado Bien de Interés Cultural el 11 de julio de 2022.